1 | Suzuki M. M. ; Bird A. Nat. Rev. Genet. 2008, 9, 465. |
2 | Bhutani N. ; Burns D. M. ; Blau H. M. Cell 2011, 146, 866. |
3 | Chapman C. G. ; Mariani C. J. ; Wu F. ; Meckel K. ; Butun F. ; Chuang A. ; Madzo J. ; Bissonette M. B. ; Kwon J. H. ; Godley L. A. Sci. Rep. 2015, 5, 17568. |
4 | Huang H. ; Jiang X. ; Li Z. ; Li Y. ; Song C. X. ; He C. ; Sun M. ; Chen P. ; Gurbuxani S. ; Wang J. ; Hong G. M. ; Elkahloun A. G. ; Arnovitz S. ; Wang J. ; Szulwach K. ; Lin L. ; Street C. ; Wunderlich M. ; Dawlaty M. ; Neilly M. B. ; Jaenisch R. ; Yang F. C. ; Mulloy J. C. ; Jin P. ; Liu P. P. ; Rowley J. D. ; Xu M. ; He C. ; Chen J. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013, 110, 11994. |
5 | Strahl B. D. ; Allis C. D. Nature 2000, 403, 41. |
6 | Klose R. J. ; Kallin E. M. ; Zhang Y. Nat. Rev. Genet. 2006, 7, 715. |
7 | Shi Y. Nat. Rev. Genet. 2007, 8, 829. |
8 | Jia G. ; Fu Y. ; Zhao X. ; Dai Q. ; Zheng G. ; Yang Y. ; Yi C. ; Lindahl T. ; Pan T. ; Yang Y. G. ; He C. Nat. Chem. Biol. 2011, 7, 885. |
9 | He C. Nat. Chem. Biol. 2010, 6, 863. |
10 | Cantara W. A. ; Crain P. F. ; Rozenski J. ; McCloskey J. A. ; Harris K. A. ; Zhang X. ; Vendeix F. A. P. ; Fabris D. ; Agris P. F. Nucleic Acids Res. 2011, 39, D195. |
11 | Harper J. E. ; Miceli S. M. ; Roberts R. J. ; Manley J. L. Nucleic Acids Res. 1990, 18, 5735. |
12 | Narayan P. ; Rottman F. M. Science 1988, 242, 1159. |
13 | Dubin D. T. ; Taylor R. H. Nucleic Acids Res. 1975, 2, 1653. |
14 | Krug R. M. ; Morgan M. A. ; Shatkin A. J. J. Virol. 1976, 20, 45. |
15 | Wei C. M. ; Moss B. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1975, 72, 318. |
16 | Adams J. M. ; Cory S. Nature 1975, 255, 28. |
17 | Furuichi Y. ; Morgan M. ; Shatkin A. J. ; Jelinek W. ; Salditt-Georgieff M. ; Darnell J. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1975, 72, 1904. |
18 | Desrosiers R. ; Friderici K. ; Rottman F. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1974, 71, 3971. |
19 | Wei C. M. ; Moss B. Biochemistry 1977, 16, 1672. |
20 | Levis R. ; Penman S. J. Mol. Biol. 1978, 120, 487. |
21 | Haugland R. A. ; Cline M. G. Eur. J. Biochem. 1980, 104, 271. |
22 | Nichols J. L. ; Welder L. Plantence Letters 1981, 21, 75. |
23 | Clancy M. J. ; Shambaugh M. E. ; Timpte C. S. ; Bokar J. A. Nucleic Acids Res. 2002, 30, 4509. |
24 | Saneyoshi M. ; Harada F. ; Nishimura S. BBA Section Nucleic Acids And Protein Synthesis 1969, 190, 264. |
25 | Iwanami Y. ; Brown G. M. Arch. Biochem. Biophys. 1968, 126, 8. |
26 | Bringmann P. ; Lührmann R. FEBS Lett. 1987, 213, 309. |
27 | Bokar J. A. ; Shambaugh M. E. ; Polayes D. ; Matera A. G. ; Rottman F. M. RNA 1997, 3, 1233. |
28 | Liu J. ; Yue Y. ; Han D. ; Wang X. ; Fu Y. ; Zhang L. ; Jia G. ; Yu M. ; Lu Z. ; Deng X. ; Dai Q. ; Chen W. ; He C. Nat. Chem. Biol. 2014, 10, 93. |
29 | Fu Y. ; Dominissini D. ; Rechavi G. ; He C. Nat. Rev. Genet. 2014, 15, 293. |
30 | Schwartz S. ; Mumbach M. R. ; Jovanovic M. ; Wang T. ; Maciag K. ; Bushkin G. G. ; Mertins P. ; Ter-Ovanesyan D. ; Habib N. ; Cacchiarelli D. ; Sanjana N. E. ; Freinkman E. ; Pacold M. E. ; Satija R. ; Mikkelsen T. S. ; Hacohen N. ; Zhang F. ; Carr S. A. ; Lander E. S. ; Regev A. Cell reports 2014, 8, 284. |
31 | Zheng G. ; Dahl J. A. ; Niu Y. ; Fedorcsak P. ; Huang C. M. ; Li C. J. ; Vagbo C. B. ; Shi Y. ; Wang W. L. ; Song S. H. ; Lu Z. ; Bosmans R. P. ; Dai Q. ; Hao Y. J. ; Yang X. ; Zhao W. M. ; Tong W. M. ; Wang X. J. ; Bogdan F. ; Furu K. ; Fu Y. ; Jia G. ; Zhao X. ; Liu J. ; Krokan H. E. ; Klungland A. ; Yang Y. G. ; He C. Mol. Cell 2013, 49, 18. |
32 | Dominissini D. ; Moshitch-Moshkovitz S. ; Schwartz S. ; Salmon-Divon M. ; Ungar L. ; Osenberg S. ; Cesarkas K. ; Jacob-Hirsch J. ; Amariglio N. ; Kupiec M. ; Sorek R. ; Rechavi G. Nature 2012, 484, 201. |
33 | Meyer K. D. ; Saletore Y. ; Zumbo P. ; Elemento O. ; Mason C. E. ; Jaffrey S. R. Cell 2012, 149, 1635. |
34 | Kennedy T. D. ; Lane B. G. Can. J. Biochem. 1979, 57, 927. |
35 | Zhong S. ; Li H. ; Bodi Z. ; Button J. ; Vespa L. ; Herzog M. ; Fray R. G. The Plant Cell 2008, 20, 1278. |
36 | Bodi Z. ; Zhong S. ; Mehra S. ; Song J. ; Graham N. ; Li H. ; May S. ; Fray R. G. Frontiers in Plant Science 2012, 3, 48. |
37 | Shen L. ; Liang Z. ; Gu X. ; Chen Y. ; Teo Z.W. ; Hou X. ; Cai W. M. ; Dedon P. C. ; Liu L. ; Yu H. Dev. Cell 2016, 38, 186. |
38 | Sommer S. ; Salditt-Georgieff M. ; Bachenheimer S. ; Darnell J. E. ; Furuichi Y. ; Morgan M. ; Shatkin A. J. Nucleic Acids Res. 1976, 3, 749. |
39 | Canaani D. ; Kahana C. ; Lavi S. ; Groner Y. Nucleic Acids Res. 1979, 6, 2879. |
40 | Kane S. E. ; Beemon K. Mol. Cell. Biol. 1985, 5, 2298. |
41 | Keith G. Biochimie 1995, 77, 142. |
42 | Rottman F. M. ; Desrosiers R. C. ; Friderici K. Prog. Nucleic Acid Res. Mol. 1977, 19, 21. |
43 | Luo G. Z. ; MacQueen A. ; Zheng G. ; Duan H. ; Dore L. C. ; Lu Z. ; Liu J. ; Chen K. ; Jia G. ; Bergelson J. ; He C. Nat Commun 2014, 5, 5630. |
44 | Schwartz S. ; Agarwala S. D. ; Mumbach M. R. ; Jovanovic M. ; Mertins P. ; Shishkin A. ; Tabach Y. ; Mikkelsen T. S. ; Satija R. ; Ruvkun G. ; Carr S. A. ; Lander E. S. ; Fink G. R. ; Regev A. Cell 2013, 155, 1409. |
45 | Li Y. ; Wang X. ; Li C. ; Hu S. ; Yu J. ; Song S. RNA Biol. 2014, 11, 1180. |
46 | Aguilo F. ; Zhang F. ; Sancho A. ; Fidalgo M. ; Di Cecilia S. ; Vashisht A. ; Lee D. F. ; Chen C. H. ; Rengasamy M. ; Andino B. ; Jahouh F. ; Roman A. ; Krig S. R. ; Wang R. ; Zhang W. ; Wohlschlegel J. A. ; Wang J. ; Walsh M. J. Cell Stem Cell 2015, 17, 689. |
47 | Linder B. ; Grozhik A. V. ; Olarerin-George A. O. ; Meydan C. ; Mason C. E. ; Jaffrey S. R. Nat. Methods 2015, 12, 767. |
48 | Rottman F. M. ; Bokar J. A. ; Narayan P. ; Shambaugh M. E. ; Ludwiczak R. Biochimie 1994, 76, 1109. |
49 | Shah J. C. ; Clancy M. J. Mol. Cell. Biol. 1992, 12, 1078. |
50 | Hongay C. F. ; Orr-Weaver T. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011, 108, 14855. |
51 | Bujnicki M. J. ; Feder M. ; Radlinska M. ; Blumenthal M. R. J. Mol. Evol. 2002, 55, 431. |
52 | Liu J. ; Yue Y. ; Han D. ; Wang X. ; Fu Y. ; Zhang L. ; Jia G. ; Yu M. ; Lu Z. ; Deng X. ; Dai Q. ; Chen W. ; He C. Nat. Chem. Biol. 2014, 10, 93. |
53 | Ping X. L. ; Sun B. F. ; Wang L. ; Xiao W. ; Yang X. ; Wang W. J. ; Adhikari S. ; Shi Y. ; Lv Y. ; Chen Y. S. ; Zhao X. ; Li A. ; Yang Y. ; Dahal U. ; Lou X. M. ; Liu X. ; Huang J. ; Yuan W. P. ; Zhu X. F. ; Cheng T. ; Zhao Y. L. ; Wang X. ; Danielsen J. M. R. ; Liu F. ; Yang Y. G. Cell Res. 2014, 24, 177. |
54 | Wang X. ; Feng J. ; Xue Y. ; Guan Z. ; Zhang D. ; Liu Z. ; Gong Z. ; Wang Q. ; Huang J. ; Tang C. ; Zou T. ; Yin P. Nature 2016, 534, 575. |
55 | Schwartz S. ; Mumbach M. R. ; Jovanovic M. ; Wang T. ; Maciag K. ; Bushkin G. G. ; Mertins P. ; Ter-Ovanesyan D. ; Habib N. ; Cacchiarelli D. ; Sanjana N. E. ; Freinkman E. ; Pacold M. E. ; Satija R. ; Mikkelsen T. S. ; Hacohen N. ; Zhang F. ; Carr S. A. ; Lander E. S. ; Regev A. Cell reports 2014, 8, 284. |
56 | Agarwala S. D. ; Blitzblau H. G. ; Hochwagen A. ; Fink G. R. PLoS Genet. 2012, 8, e1002732. |
57 | Mielecki D. ; Zugaj D. L. ; Muszewska A. ; Piwowarski J. ; Chojnacka A. ; Mielecki M. ; Nieminuszczy J. ; Grynberg M. ; Grzesiuk E. PLoS One 2012, 7, e30588. |
58 | Dinglay S. ; Trewick S. C. ; Lindahl T. ; Sedgwick B. Genes Dev. 2000, 14, 2097. |
59 | Ringvoll J. ; Nordstrand L. M. ; V?gb? C.B. ; Talstad V. ; Reite K. ; Aas P. A. ; Lauritzen K. H. ; Liabakk N. B. ; Bj?rk A. ; Doughty R. W. ; Falnes P.?. ; Krokan H. E. ; Klungland A. The EMBO Journal 2006, 25, 2189. |
60 | Li M. M. ; Nilsen A. ; Shi Y. ; Fusser M. ; Ding Y. H. ; Fu Y. ; Liu B. ; Niu Y. ; Wu Y. S. ; Huang C. M. ; Olofsson M. ; Jin K. X. ; Lv Y. ; Xu X. Z. ; He C. ; Dong M. Q. ; Rendtlew Danielsen J. M. ; Klungland A. ; Yang Y. G. Nat Commun 2013, 4, 1832. |
61 | Li X. ; Xiong X. ; Wang K. ; Wang L. ; Shu X. ; Ma S. ; Yi C. Nat. Chem. Biol. 2016, 12, 311. |
62 | Wang X. ; Lu Z. ; Gomez A. ; Hon G. C. ; Yue Y. ; Han D. ; Fu Y. ; Parisien M. ; Dai Q. ; Jia G. ; Ren B. ; Pan T. ; He C. Nature 2014, 505, 117. |
63 | Xiao W. ; Adhikari S. ; Dahal U. ; Chen Y. S. ; Hao Y. J. ; Sun B. F. ; Sun H. Y. ; Li A. ; Ping X. L. ; Lai W. Y. ; Wang X. ; Ma H. L. ; Huang C. M. ; Yang Y. ; Huang N. ; Jiang G. B. ; Wang H. L. ; Zhou Q. ; Wang X. J. ; Zhao Y. L. ; Yang Y. G. Mol. Cell 2016, 61, 507. |
64 | Wang X. ; Zhao B. S. ; Roundtree I. A. ; Lu Z. ; Han D. ; Ma H. ; Weng X. ; Chen K. ; Shi H. ; He C. Cell 2015, 161, 1388. |
65 | Li D. ; Zhang H. ; Hong Y. ; Huang L. ; Li X. ; Zhang Y. ; Ouyang Z. ; Song F. Plant Mol. Biol. Rep. 2014, 32, 1169. |
66 | Xu C. ; Wang X. ; Liu K. ; Roundtree I. A. ; Tempel W. ; Li Y. ; Lu Z. ; He C. ; Min J. Nat. Chem. Biol. 2015, 11, 815. |
67 | Zhao X. ; Yang Y. ; Sun B. F. ; Shi Y. ; Yang X. ; Xiao W. ; Hao Y. J. ; Ping X. L. ; Chen Y. S. ; Wang W. J. ; Jin K. X. ; Wang X. ; Huang C. M. ; Fu Y. ; Ge X. M. ; Song S. H. ; Jeong H. S. ; Yanagisawa H. ; Niu Y. ; Jia G. F. ; Wu W. ; Tong W. M. ; Okamoto A. ; He C. ; Rendtlew Danielsen J. M. ; Wang X. J. ; Yang Y. G. Cell Res 2014, 24, 1403. |
68 | Xiao W. ; Adhikari S. ; Dahal U. ; Chen Y. S. ; Hao Y. J. ; Sun B. F. ; Sun H. Y. ; Li A. ; Ping X. L. ; Lai W. Y. ; Wang X. ; Ma H. L. ; Huang C. M. ; Yang Y. ; Huang N. ; Jiang G. B. ; Wang H. L. ; Zhou Q. ; Wang X. J. ; Zhao Y. L. ; Yang Y. G. Mol Cell 2016, 61, 507. |
69 | Patil D. P. ; Chen C. K. ; Pickering B. F. ; Chow A. ; Jackson C. ; Guttman M. ; Jaffrey S. R. Nature 2016, 537, 369. |
70 | Chen H. M. ; Futcher B. ; Leatherwood J. PLoS One 2011, 6, e26804. |
71 | Harigaya Y. ; Tanaka H. ; Yamanaka S. ; Tanaka K. ; Watanabe Y. ; Tsutsumi C. ; Chikashige Y. ; Hiraoka Y. ; Yamashita A. ; Yamamoto M. Nature 2006, 442, 45. |
72 | Ok S. H. ; Jeong H. J. ; Bae J. M. ; Shin J. S. ; Luan S. ; Kim K. N. Plant Physiol. 2005, 139, 138. |
73 | Bruggeman Q. ; Garmier M. ; de Bont L. ; Soubigou-Taconnat L. ; Mazubert C. ; Benhamed M. ; Raynaud C. ; Bergounioux C. ; Delarue M. Plant Physiol. 2014, 165, 732. |
74 | Geula S. ; Moshitch-Moshkovitz S. ; Dominissini D. ; Mansour A. A. ; Kol N. ; Salmon-Divon M. ; Hershkovitz V. ; Peer E. ; Mor N. ; Manor Y. S. ; Ben-Haim M. S. ; Eyal E. ; Yunger S. ; Pinto Y. ; Jaitin D. A. ; Viukov S. ; Rais Y. ; Krupalnik V. ; Chomsky E. ; Zerbib M. ; Maza I. ; Rechavi Y. ; Massarwa R. ; Hanna S. ; Amit I. ; Levanon E. Y. ; Amariglio N. ; Stern-Ginossar N. ; Novershtern N. ; Rechavi G. ; Hanna J. H. Science 2015, 347, 1002. |
75 | Fustin J. M. ; Doi M. ; Yamaguchi Y. ; Hida H. ; Nishimura S. ; Yoshida M. ; Isagawa T. ; Morioka M. S. ; Kakeya H. ; Manabe I. ; Okamura H. Cell 2013, 155, 793. |
76 | Zhou J. ; Wan J. ; Gao X. ; Zhang X. ; Jaffrey S. R. ; Qian S. B. Nature 2015, 526, 591. |