以亮氨酸合成为例刍议代谢中的生物化学相似性规律

蒋振雄,王鹏,马新雨,田杰,张军,姜汉杰,石瑾慧,王志鹏

Discussion on the Biochemical Similarity in Metabolic Principles Based on Leucine Biosynthesis Pathway

Zhenxiong JIANG,Peng WANG,Xinyu MA,Jie TIAN,Jun ZHANG,Hanjie JIANG,Jinhui SHI,Zhipeng A. WANG

图6 β-异丙基苹果酸脱氢酶活性位点结构示意图 A)图示拟南芥的β-异丙基苹果酸脱氢酶与NAD+的结合模式(PDB ID: 5J33)。其中，蛋白质显示为二级结构。黑色箭头所指为NAD+，红色球体为Mg2+；B)图示拟南芥β-异丙基苹果酸脱氢酶与底物的结合模式(PDB ID: 5J32)，显示活性位点的关键氨基酸Y181，D288，D292。红色球体为Mg2+；C)图示Thermus thermophilus的高异柠檬酸脱氢酶(PDB ID: 4YB4)，黑色箭头所指为NAD+类似物，红色球体为Mg2+；D)图示Escherichia coli的异柠檬酸脱氢酶(PDB ID: 1CW1)，紫色球体为Mn2+ 电子版为彩图