| 药物与靶标的结合 | 本质属于分子间作用力，需要药物与靶标结合位点在空间体积、电性分布等高度契合 | 锁钥结合模型 |
| 前药 | 是指药物经过化学结构修饰后得到的在体外无活性或活性较小、在体内经酶或非酶的转化释放出活性药物而发挥药效的化合物 | 伪装者 |
| 载药系统 | “运载”药物的系统 | 导弹 |
| 基于化合物库筛选的药物发现 | 化合物库结构多样性、精准药物设计 | 猎人打猎，猎物要多、质量要好、枪法要准 |
| 选择性抑制剂设计策略 | 蛋白家族结构上的差异 | “一母生九子，九子各不同” |
| 药物耐药性与抗耐药药物设计 | 耐药性又称抗药性，指微生物及肿瘤细胞对于化疗药物作用的耐受性，耐药性一旦产生，药物的化疗作用就明显下降 | “道高一尺，魔高一丈” |
| 抗耐药性药物设计策略 | 靶向关键位点 | 一夫当关，万夫莫开；以不变应万变 |
| 分子柔性与刚性 | 柔性可以提高抗耐药性；刚性可以提高选择性 | 适应环境的变化，做人也应该刚柔并济。太灵活则不专一(选择性不好)；太死板则契合性不好(构象刚性) |
| 共价结合药物 | 是一类可完全关闭和沉默引发疾病的蛋白活性的药物。它的效果强且持久，远高于常规药物 | 非共价结合部分与共价结合基团类似枪的枪柄和弹头；效果“一剑封喉” |
| “Escaping from Flatland”理念[18-20] | 除了苯环、芳香杂环外，尽可能选用螺环、桥环、sp3杂化碳较多基团、磷、硅、二茂铁等的依据 | 人要拒绝平庸，化合物要拒绝平坦 |
| 蛋白-蛋白相互作用(稳定化剂) | 是指两个或两个以上的蛋白质分子通过非共价键形成蛋白质复合物的过程 | 人与人之间要保持合理的社交距离 |
| 药物蛋白靶标 | 结构蛋白与功能蛋白 | 病毒衣壳等结构蛋白比做“厂房”；催化性功能蛋白比作“加工机器” |
| 药物的药效团特征 | 药效团是药物被生物靶标进行分子识别所必需的物理化学特征及其空间排布 | 第一代HIV非核苷类逆转录酶抑制剂的“蝴蝶”型药效团，分为躯干、左翼、右翼。分子结构一般分为躯干、头、尾。HIV核糖核酸水解酶抑制剂分为躯干与双翅膀等 |
| Proximity效应[21] | 例如，磺酰氟的稳定性与反应性(图 1) | 邻居与路人 |