《分子模拟》教材建设的探索与实践

张恒, 贾春江, 宋其圣, 苑世领

Exploration and Practice of Textbook Construction of Molecular Simulation

Heng Zhang, Chunjiang Jia, Qisheng Song, Shiling Yuan

表2 国内外出版的分子模拟相关的教材

出版时间 教材名称 编者 出版社 内容特色 1987年 第一版 2017年 第二版 Computer Simulation of Liquids M. P. Allen and D. J. Tildesley Oxford University Press 分子模拟领域的第一本专著，对于分子模拟的基本原理和概念有很好的论述，同时配有较多程序示例，对于理解分子动力学算法较有帮助 1996年 第一版 2001年 第二版 Understanding Molecular Simulation Daan Frenkel and Berend Smit Elsevier 对分子动力学和蒙特卡洛方法进行了深入介绍，对其实现提供了详细代码，另有汪文川翻译的中文版 1997年 第一版 2001年 第二版 Molecular Modeling-Principles and Application A. R. Leach Prentice Hall 分子模拟领域的入门教材，内容全面深入 1998年 第一版 2007年 第二版 2017年 第三版 Introduction to Computational Chemistry Frank Jensen John Wiley & Sons 综合类教材，选材较广，偏重量子化学计算，分子力学方法亦有涉及。除理论外，对实际计算中的问题亦有讨论 2002年 第一版 2004年 第二版 Essentials of Computational Chemistry Christopher J. Cramer John Wiley & Sons 综合类教材，涉及面较广，亦以量子化学计算为主 2002年 第一版 2010年 第二版 Molecular Modeling and Simulation：An Interdisciplinary Guide Tamar Schlick Springer 对分子模拟在生物体系中的应用进行了详细介绍 2004年 第二版 The Art of Molecular Dynamics Simulation D. C. Rapaport Cambridge University Press 针对分子模拟涉及到的技术问题均给出了详细的程序代码，适合作为自编程序参考书 2011年 Introduction to Practice of Molecular Simulation-Molecular Dynamics, Monte Carlo, Brownian Dynamics, Lattice Boltzmann and Dissipative Particle Dynamics Akira Satoh Elsevier 有较丰富的程序代码，适合作为自编程序参考书 2013年 第七版 Quantum Chemistry Ira N. Levine Prentice Hall 对量子化学计算相关的理论基础知识进行了详细深入地介绍 2004年 分子模拟-从算法到应用 汪文川 化学工业出版社 译自Understanding Molecular Simulation 2007年 分子模拟的理论与实践 陈正隆 化学工业出版社 专著类，对分子力学方法进行了介绍 2008年 计算化学实验 胡红智、马思渝 北京师范大学出版社 精编了10个量子化学计算实验 2009年 计算化学-从理论化学到分子模拟 陈敏伯 科学出版社 对分子力学方法和相关性质的计算进行了介绍，需要有较强的数理基础 2010年 分子模拟实验 王宝山、侯华 高等教育出版社 实验为主的教材，也包含理论介绍，偏重量子化学计算实验 2010年 软物质的计算机模拟与理论方法 杨小震等 化学工业出版社 专著类，对聚合物、表面活性剂等胶体化学领域模拟涉及到的理论方法进行了介绍 2016年 蛋白质模拟-原理、发展和应用 王存新等 科学出版社 专著类，着重对蛋白质模拟相关的理论及应用进行了介绍 2016年 第一版 2022年 第二版 分子模拟 苑世领等 化学工业出版社 理论与实验并重，偏重分子力学方法，其中实验部分有非常详细的操作方法介绍 2018年 高等物理化学实习讲义 刘迎春等 高等教育出版社 选取了12个包含量子化学计算和分子力学计算的计算实例