认识空间群
Understanding Space-Group
通讯作者:
收稿日期: 2018-11-6 接受日期: 2018-12-12
Received: 2018-11-6 Accepted: 2018-12-12
利用晶体学国际表简要介绍了空间群的有关知识及等效点系、不对称单位等概念。
关键词:
Knowledge of space-group and symmetrically equivalent points as well as asymmetric unit was briefly introduced according to the International Tables for Crystallography.
Keywords:
本文引用格式
朱月香.
ZHU Yuexiang.
空间群、等效点系等概念对于晶体结构的表达至关重要,正确理解空间群的有关信息对于晶体结构的学习及阅读有关文献都很有帮助。本文简要介绍晶体学国际表中空间群和晶体结构表达的有关知识。
空间群是晶体空间对称操作的集合,是在32个点群的基础上,考虑实际晶体结构中对应的微观对称元素,再结合可能存在的点阵型式得到的。晶体中可能存在的宏观对称元素有1, 2, 3, 4, 6次旋转轴和反轴,1次反轴就是对称中心,2次反轴就是镜面。把晶体中可能存在的宏观对称元素通过一个公共点组合起来,共有32种型式,称为32个晶体学点群。但点群中的每个对称元素在实际晶体的三维空间结构中对应的微观对称元素可能有多种。比如,宏观上的四重旋转轴在微观上既可能是四重旋转轴,也可能是41, 42, 43次螺旋轴;点群中的镜面在微观上可能是镜面,也可能是a, b, c, n, d滑移面。再结合可能存在的点阵型式,一个点群就会派生出很多个空间群。32个点群总共有230个空间群。如果实际存在的微观对称元素与宏观对称元素一致,这样的空间群称为点式空间群,共有73个。
比如,C2h点群,有一个2重轴,和垂直于2重轴的镜面,属于单斜晶系,存在简单单斜及C心单斜两种点阵型式。2重轴可以是旋转轴也可以是螺旋轴,镜面还可以是滑移面,这样从C2h点群就可以派生出如下6个空间群。其中1和3是点式空间群。属于这两个空间群的晶体,其内部实际存在的对称元素是2次旋转轴和镜面,与宏观观察中表现出的对称元素是一致的。
空间群的知识对晶体学、化学、材料科学及其相关学科都极为有用。230个空间群的详细信息都列在晶体学国际表里。为了能看懂这些信息,需要了解以下内容。
1 空间群的记号
比如,
短线左边的是空间群的Schonflies记号,代表D2h点群的第16号空间群,短线右边是空间群的国际记号,P代表其点阵型式是简单正交,后面部分代表不同方向上的对称元素。不同晶系三个位置所代表的方向是不一样的,如表1所示。三方晶系曾采用菱面体晶胞,此时第一个位置代表a+b+c方向,第二个位置代表a-b方向;现在晶体学国际表给出的空间群国际记号中采用六方晶胞,各个位置代表的方向也与六方晶系相同;第一个位置代表特征对称元素的方向c方向;第二个位置代表a方向;第三个位置代表2a+b方向,就是与a垂直的方向。
表1 国际记号中三个位置所代表的方向
| 晶系 | 1 | 2 | 3 |
| 立方晶系 | a | a+b+c | a+b |
| 六方晶系 | c | a | 2a+b |
| 四方晶系 | c | a | a+b |
| 三方晶系 | a+b+c | a-b | |
| 三方晶系 | c | a | 2a+b |
| 正交晶系 | a | b | c |
| 单斜晶系 | b |
D2h点群属于正交晶系,第一个位置代表a方向,第二个位置代表b方向,第三个位置代表c方向。所以,这个符号就告诉我们,平行于晶体的a方向有21次螺旋轴,垂直于a方向有n滑移面;平行于晶体的b方向有21次螺旋轴,垂直于b方向有镜面;平行于晶体的c方向有21次螺旋轴,垂直于c方向有a滑移面。
再看C2h点群第5号空间群:
很多有机晶体都属于这个空间群。点阵型式为简单单斜,平行于b方向有21螺旋轴,垂直于b方向有c滑移面。这个螺旋轴和滑移面的具体位置可以从晶体学国际表上查到。
2 空间群中对称元素的分布
图1
图2是D4点群第1号空间群的对称元素及等效点系分布图。D4点群的对称元素有一个4重旋转轴和4个垂直于C4轴的C2轴,属于四方晶系。P422这个记号代表点阵型式是简单四方,平行于c方向有4次旋转轴,平行于a方向有2次旋转轴,平行于a+b方向也有2次旋转轴。这些轴的具体位置如下:4次轴通过晶胞原点及中心,通过晶胞原点平行于a方向及a+b方向有2次旋转轴。通过棱心平行于c方向及a方向有2次旋转轴,平行于a+b方向有21螺旋轴。
图2
3 等效点系
等效点系从原子排列的方式表达晶体结构的对称性,对学习晶体结构有重要意义。等效点系就是由对称性联系、等效的一组点。从这一组点中的任意一点出发,由对称操作都可以导出其余点。
图3
表中最上面的是一般位置等效点系的坐标,下面的是特殊位置等效点系的坐标。最左边的一列数字表示等效点系中点的数目,第二列从下到上按26个字母的顺序表示特殊位置等效点系,第三列是位点的对称性,最下面的对称性最高。位置a就是晶胞原点,最上面的位点对称性是1,表示一般位置。
一般等效点系中点的数目由点群的阶次及点阵型式决定,等于点群的阶次与一个点阵单位中点阵点的数目的乘积。第89号空间群为简单四方点阵,D4点群,阶次为8,一般等效点系中点的数目也为8;第97号空间群也是D4点群,但点阵型式为体心四方,因此其一般等效点系中点的数目为16,如表3所示,其中(0, 0, 0)和(1/2, 1/2, 1/2)表示点阵点的坐标。给定一个点的坐标,根据表中给出的8个坐标可以得到8个点;每个坐标的x, y, z都加上1/2又可以得到8个,总共可以得到16个。
4 不对称单位
不对称单位就是晶胞中没有对称性联系的那部分原子或空间。在晶体学国际表中,每个空间群给出的不对称单位是一个空间区域,对于具体的晶体,我们关注的是原子。由晶胞中一个原子A,通过所有的对称操作,可得到一组A,这一组A就属于一个等效点系。晶胞中可能还有一部分A原子不属于这个等效点系,记为A’,由A’通过所有的对称操作可得到一组A’,这一组A’也属于一个等效点系。同样,由原子B,C……通过所有的对称操作可得到一组B,C……。原子A,A’,B,C……之间无对称性联系,这些原子就构成不对称单位。
表4 Li4Au的结构信息
| Li4Au | I4/mmm | 100 GPa | a=3.1265 | Li | 4e | 0.50000 | 0.50000 | 0.38317 |
| c= 7.3038 | Li | 4d | 0.50000 | 0.00000 | 0.25000 | |||
| Au | 2b | 0.00000 | 0.00000 | 0.50000 |
该化合物为四方晶系晶体,属139号空间群,点阵型式为体心四方。其中Li占据两套等效点系,不对称单位包含2个Li原子,1个Au原子。该空间群部分等效点系坐标如表5所示。由表4和表5便可得到晶胞内所有原子的坐标。8个Li的坐标为:(0.50000, 0.50000, 0.38317), (0.50000, 0.50000, 0.61683), (0.00000, 0.00000, 0.88317), (0.00000, 0.00000, 0.11683), (0.50000, 0.00000, 0.25000), (0.00000, 0.50000, 0.25000), (0.00000, 0.50000, 0.75000), (0.50000, 0.00000, 0.75000)。2个Au的坐标为:(0.00000, 0.00000, 0.50000), (0.50000, 0.50000, 0.00000)。由此即可得知晶胞结构。
5 结语
本文利用晶体学国际表简要介绍了空间群的记号、空间群中对称元素的分布、等效点系和不对称单位等概念,希望能帮助大家更好地学习晶体结构的知识并正确理解文献中的相关信息。
参考文献
DOI:10.1021/jacs.5b11768 [本文引用: 1]
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