大学化学, 2022, 37(6): 2107104-0 doi: 10.3866/PKU.DXHX202107104

师生笔谈

模拟计算纳入现代分析技术课程的初探

温大尉,

Exploration of Introducing Simulation & Calculation in Modern Analytical Technology Curriculum

Wen Dawei,

通讯作者: 温大尉, Email: ontaii@163.com

收稿日期: 2021-07-28   接受日期: 2021-08-11  

基金资助: 五邑大学高层次人才计划.  2019TP007
江门市科技项目.  (2017) 307
江门市科技项目.  (2017) 149
江门市科技项目.  (2018) 352
广东省高等学校光电材料与应用重点实验室.  2017KSYS011
广东省普通高校重点领域专项(新一代信息技术).  2021ZDZX1022
五邑大学教学质量工程与教学改革工程项目.  JX2019072

Received: 2021-07-28   Accepted: 2021-08-11  

Abstract

Modern analytical technology is a curriculum of materials analysis and instrumentation. The basic theories of materials analysis contain microscale objects and complicated mathematical contents. It is uneasy for students to understand the knowledge by the traditional education method. Therefore, the simulation of powder X-ray diffraction and Raman scattering spectrum with computers serve as two teaching examples for the education research. The results demonstrate computational simulation explains the interaction of instruments and materials in an easy, intuitive and visual way, helping students in the future work of engineering or scientific research.

Keywords: Crystal ; X-ray diffraction ; Raman scattering ; Simulation of powder diffraction ; Density functional theory

PDF (742KB) 元数据 多维度评价 相关文章 导出 EndNote| Ris| Bibtex  收藏本文

本文引用格式

温大尉. 模拟计算纳入现代分析技术课程的初探. 大学化学[J], 2022, 37(6): 2107104-0 doi:10.3866/PKU.DXHX202107104

Wen Dawei. Exploration of Introducing Simulation & Calculation in Modern Analytical Technology Curriculum. University Chemistry[J], 2022, 37(6): 2107104-0 doi:10.3866/PKU.DXHX202107104

现代分析技术是一门主要面向化学、材料、物理、环境等专业硕士研究生的专业基础课或专业选修课。以笔者所在单位为例,现代分析技术课程作为必修课,面向材料与化工和材料科学与工程专业的硕士研究生。此课程主要分成原理和实操两部分,前者讲解X射线衍射、扫描电镜、透射电镜、紫外-可见吸收光谱、红外吸收光谱、拉曼散射光谱、核磁共振和色谱等测试分析技术,实操则是实际操作仪器进行测试。这些技术都是基于物质的物理或化学性质的分析手段,通过特殊的光学或者电子等探测方法与物质内部的原子和电子起相互作用,定量或者定性地分析物质的成分和微观结构。物理、化学、材料、环境等理工类研究生在完成研究课题的过程中,往往需要用到以上技术。比如,材料的晶体结构和晶体表面形貌与催化活性非常相关,主攻光催化材料的研究生常常需要使用X射线粉末衍射、红外、拉曼光谱和透射电镜的选区电子衍射表征催化剂的结构,使用扫描电镜观察材料表面形貌。另外,掌握现代分析技术的知识,为将来的毕业实习及作为工程师或科研人员的就业,提供必备素质和专项技能。因此,现代分析技术对于基础科学的理工类研究生极为重要。

现代分析技术的测试与物质内部或表面息息相关,在教学中涉及到原子、离子、化学键与振动、晶体结构和数学公式(比如X射线的布拉格公式)等。这些微观概念无法直接通过肉眼观察,在生活中几乎无法接触到,对学生而言过于抽象[1, 2]。比如,教学中的一个突出问题是物质结构与测试结果的逻辑关系:物质结构的微小变化,会导致测试结果如何变化?反过来测试结果的差异意味着物质结构发生怎样的变化?因此,传统的教学模式难以满足教学需求,需要研究新型的教学方法。20–21世纪计算机无论在硬件还是软件方面,发展都非常迅猛,为材料的谱学模拟提供了可能。通过晶体学和密度泛函理论软件,可以根据晶体微观结构,模拟实验测试结果。如果修改了晶体的参数或者原子位置,X射线衍射和拉曼光谱的发射峰位置和强度都会发生相应的变化,这样结构与测试结果的联系,可以通过计算机“实时”观察到,可以使师生都产生参与感[3]。本文通过2个教学实例,利用晶体学软件和第一性原理计算软件,把抽象的晶体学概念以生动形象的形式呈现出来,帮助学生建立现代分析技术的知识框架。

1 使用Rietan FP模拟Na1-xKxCl的X射线粉末衍射谱

X射线衍射基于布拉格公式,其中d为晶面距,λ为X射线的波长:

可见,晶面距如果变大,则对应的衍射角会下降。但是,数学表达对学生而言不容易理解,而且没有X射线衍射谱作为例子,过于抽象,很难给学生留下深刻的印象。因此,X射线粉末衍射谱的讲解结合软件模拟,进行如下设计:

① 选择结构相对简单的物质进行模拟,学生容易理解物质内部的变化;

② 选择生活中较为常见的物质,增加学生的兴趣,降低学生的心理门槛;

③ 该物质能形成固溶体,晶面距$ d $发生变化最终能影响衍射图谱;

④ 模拟一系列固溶体,并观察衍射峰位与晶胞参数的关系;

⑤ 使用免费软件Rietan FP,可以完全避免版权纠纷,只需要引用原作者的论文即可(Rietan FP是日本国立材料研究所研发的软件包,主要用于X射线衍射或者中子衍射的精修和图谱模拟) [4]。

根据以上设计理念,选择食盐与氯化钾(NaCl-KCl)固溶体,符合结构简单、生活中常见的原则。NaCl-KCl固溶体为立方晶系,空间群为$ Fm\bar 3m $,金属离子处于晶胞的面心和顶角,Cl-阴离子位于每条棱的中央,NaCl和KCl混溶得Na1-xKxCl (图 1(a)),其中金属离子Na+和K+均与周围6个Cl-离子配位,形成八面体。由于K+离子6配位情况下半径为1.38 Å (1 Å = 0.1 nm),明显大于Na+ (6配位,1.02 Å),在Na1-xKxCl固溶体中,随着x增大,晶胞参数和体积均呈现线性增大的趋势(图 1(b) & (c))。

图1

图1   (a) NaCl和KCl的晶体结构图形,Na1-xKxCl的(b) a轴和(c)体积参数,(d) Na1-xKxCl的模拟X射线图谱

1 Å = 0.1 nm


使用Rietan FP软件,在输入文本内输入“NMODE = 1”,表示根据晶体结构进行X射线粉末衍射谱的模拟计算。谱峰函数选择“NPRFN = 1”,表示使用Toraya函数表示衍射峰的峰形。由于我们只需要模拟图谱,因此衍射的背景可忽略,因此背景函数“BKGD”全部设定为0。根据Na1-xKxCl中x值的变化,输入不同的结构参数进行模拟,得到如图 1(d)的衍射图谱。从模拟的图谱可见,随着x增大,晶胞参数变大200,和220衍射往低角度偏移。这种表现形式非常直观,可以让学生容易地接受X射线衍射的相关知识,深刻地认识到衍射峰位置与晶体结构的关系。

基于以上讲解,结合现在的研究前沿,如钙钛矿CsPbX3光伏和发光材料,可以给学生留下以下课后思考题:(1) CsPbCl3和CsPbBr3基本结构相同,晶胞参数有微小差异,哪个物质的晶胞参数较大?请给出原因。(2) CsPbCl3和CsPbBr3,这两种物质的衍射峰位置有什么关系?

2 通过密度泛函理论计算模拟硅的拉曼散射光谱

拉曼光谱基于入射激光与分子化学键振动相互作用,发生非弹性碰撞,激光损失一定的能量,这个能量差与化学键振动频率对应,所反映的信息可作为分子振动的指纹信息。实验中,影响拉曼光谱峰位和峰宽的因素非常多。影响峰位的因素有化学键的键强、晶体结构、温度和应力等,影响峰宽的因素有结晶度和温度等。对于拉曼光谱,一般最受关注的是峰位。排除外界影响因素,拉曼峰位可粗略用以下公式描述:

K为化学键力学常数,meff为成键原子(离子)的有效质量:

拉曼散射的产生条件是极化率的变化,因此并不是所有振动都能产生相应的拉曼散射信号,这使得学生很难直观地建立晶体结构与拉曼散射的关系。另一方面,物质内化学键的种类非常多,使得问题复杂化。基于这些原因,仪器分析技术需要与密度泛函理论计算融合,课程如此设计:

① 选择成分和结构相对简单的物质进行模拟,这类物质的化学键种类尽量少,降低学生理解问题的难度;

② 此物质的拉曼散射结果已被科研界熟知,以便确认模拟结果的正确性;

③ 此物质常用于拉曼散射实验;

④ 模拟软件选取免费的Quantum Espresso (以下简称QE)软件包,可以完全避免版权纠纷,只需要引用原作者的论文即可(QE是意大利的里雅斯特国家模拟中心开发的软件包,主要用于密度泛函理论计算,多个模块可以进行晶体结构优化、电子结构计算、介电函数计算光学性质、红外 & 拉曼光谱模拟、核磁共振模拟等) [5, 6]。

根据以上设计理念,选择硅晶体,符合成分简单,化学键种类少(只有Si-Si键)的原则。另外,单晶硅常常用于拉曼光谱的校正,其拉曼散射峰位于520–521 cm-1左右,这方面知识已被广泛接受。硅晶体为立方晶系,空间群为$ Fd\bar 3m $,每个单胞内含有8个硅原子,每个硅原子在空间中等价(图 2(a))。硅与硅之间形成只有一类的化学键,键长为~2.35 Å。这里使用的是QE6.6版本进行密度泛函理论计算。要计算拉曼光谱,需要两个过程:

图2

图2   (a) 立方晶硅的晶体结构;(b) 立方晶硅的模拟拉曼光谱


① 首先需要进行自洽场计算:设定截断能“ecutwfc”为30 Ry (约408 eV),这个能量对于计算纯硅足够高,保证一定的计算精度;自洽计算的收敛标准设定为10-6 Ry。K点为2 × 2 × 2;由于软件本身的限制,如果后续需要计算拉曼光谱,则规定使用局域梯度近似的模守恒赝势。

② 自洽场计算结束后,在得到电子状态的基础上,进行声子计算并导出拉曼光谱,结果如图 2(b)所示。

计算结果显示,硅晶体的拉曼散射峰在~517 cm-1,第一性原理的计算结果与实验值520–521 cm-1仅有3–4 cm-1的微小差别,表明模拟计算结果比较合理。现代分析技术课程包含理论授课和仪器实操两部分,模拟计算的部分属于理论授课,但是计算结果可以穿插到实验的实操上面。每天拉曼测试实验前都需要使用单晶硅做一次仪器校正,现场实操的校正光谱,可以与模拟计算的光谱进行比对,加深学生对拉曼散射知识的印象。

掺杂是材料改性的常用手段,是物理、化学和材料等方向学生的学习重点。根据上述内容,可以给学生留下课后思考题:碳和硅是同族元素,如果碳掺杂进硅晶体,部分替换了硅,那么拉曼光谱会发生什么变化?请解释原因。

3 结语

通过Rietan FP程序模拟X射线粉末衍射图谱,QE程序计算材料的拉曼光谱,与现代分析技术课程中的衍射和拉曼散射部分结合,把抽象、难懂的微观原子级别现象以简单、直观、可视化的形式表现出来并结合课程实操,有助于让学生更深入地掌握现代仪器分析的知识和物质内部规律,提高学习效果,为研究生将来成为相关专业的工程人员或科研人员夯实基础。此外,模拟计算和密度泛函理论计算与课程结合,大大丰富了现代分析技术的教学方法。

参考文献

张春芳;张翠妙;李江涛;韩琳玉;顾芳;王海军. 大学化学,2019,34(6),83.

URL     [本文引用: 1]

张鹏. 大学物理,2021,40(6),62.

URL     [本文引用: 1]

吴玉辉. 信息记录材料,2019,20(9),119.

URL     [本文引用: 1]

IzumiF.;MommaK. Solid State Phenom.2007,130,15.

DOI:10.4028/www.scientific.net/SSP.130.15      [本文引用: 1]

PaoloG.;StefanoB.;NicolaB.;MatteoC.;RobertoC.;CarloC.;DavideC.;GuidoL. C.;MatteoC.;IsmailaD.;et alJ. Phys. Condens. Matter.2009,21(39),395502.

DOI:10.1088/0953-8984/21/39/395502      [本文引用: 1]

GiannozziP.;AndreussiO.;BrummeT.;BunauO.;Buongiorno NardelliM.;CalandraM.;CarR.;CavazzoniC.;CeresoliD.;CococcioniM.; et al J. Phys. Condens. Matter.2017,29(46),465901.

DOI:10.1088/1361-648X/aa8f79      [本文引用: 1]

/

〈 〉