Cu-Zn原电池标准电动势测定实验的计算化学设计
Computational Chemistry Design of the Experiment of Determining the Copper-Zinc Glavanic Battery Standard Electromotive Force
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收稿日期: 2022-11-27 接受日期: 2023-01-28
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Received: 2022-11-27 Accepted: 2023-01-28
Based on the quantum chemical calculation software Gaussian 16, a computational chemistry design was carried out for the classical physical chemistry experiment "Determination of electromotive force". The solvation free energy of Cu2+ and Zn2+ was calculated by density functional theory, and then the standard molar Gibbs free energy change of the cell reaction was computed through the thermodynamic cycle. The standard electromotive force of the Cu-Zn glavanic battery was further derived. The experiment aims to deepen students' understanding of the basic physical chemistry concept, such as standard molar Gibbs free energy, electrode potential and Nernst equation, to give full play to students' subjective initiative, and to cultivate students' abilities of experiment designing, practice and scientific thinking.
Keywords:
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刘宇昂, 刘晓红, 李姝, 叶世海, 李国然, 言天英.
Liu Yu'ang.
计算化学实验是在计算机上开展的以分子模拟为工具,通过“理论、计算、实验”协同作用来解决各种科学问题的实验。计算化学实验具有教学成本低和实验安全性高的优点,可以帮助学生直观、深入地学习与掌握微观抽象的物理化学基本概念。“电动势的测定”实验为南开大学化学国家级实验教学示范中心面向化学、材料及环境等学科专业本科生开设的一个经典的物理化学实验,采用补偿法(对消法)原理[4]线下开展实验。借助教育信息化的机遇,通过在Cu-Zn原电池电动势的测定物理化学实验中应用信息化技术手段,以计算机作为实验工具,学生通过操作计算机上的Gaussian 16 [5]软件,结合物理化学基本理论自主完成实验。本实验可实现信息化技术与实验课程教学高度融合,突破时间与空间的限制,有效帮助学生加深对热力学循环、吉布斯自由能、电极电势、能斯特方程和电池电动势等基本概念的理解,对学生后续的课程学习及日后从事科研工作都有所帮助,为高端技术人才培养提供基础支撑。
1 实验目的
(1) 掌握Gaussian 16软件的基本使用方法,能用密度泛函方法进行理论计算,用基于密度的溶剂模型(Solvation Model Based on Density,SMD)对溶剂化自由能进行计算。
(2) 设计合理的热力学循环来求解热力学量。通过模拟得到的溶剂化自由能,结合升华能、电离能实验值,计算出Cu-Zn原电池的标准电动势。
(3) 加深对标准摩尔吉布斯自由能、电极电势、电池标准电动势等概念的理解。
2 实验原理
2.1 Cu-Zn原电池标准电动势的求解方法
在所有组分活度都为1 mol·dm−3的标准状态下,E = EӨ。电池的标准电动势为正、负极的标准电极电势之差,可利用电池反应的标准摩尔吉布斯自由能变与电池标准电动势之间的关系[8]进行计算,其计算式为:
式(2)中z为1 mol电极反应中得失电子的数目,F为法拉第常数,
本实验的温度规定为25 ℃,
2.2 电极反应的标准摩尔吉布斯自由能$ \text{变}{\text{Δ}}_{\text{r}}{{G}}_{\text{m, c}}^{\text{Ө}} $ 和$ {\text{Δ}}_{\text{r}}{{G}}_{\text{m, a}}^{\text{Ө}} $
由式(2)可知,欲求Cu-Zn原电池的标准电动势
图1
在图 1中Cu电极一侧,过程(1)表示从Cu(g)转化为Cu(s)的过程。Cu(s)的升华吉布斯自由能
可得:
结合式(2)可知,通过
表1
| 电极 | |||||
| Cu | 3.0836 | 28.0188 | −21.7335 | −9.3689 | – |
| Zn | 0.9822 | 27.3589 | −21.1638 | – | −7.1774 |
利用表 1中的
查文献[12]中的标准电极电势表得到Cu、Zn电极在25 ℃时标准电极电势分别为
通过上述计算,可知依据热力学循环计算的Cu-Zn原电池标准电动势的相对误差为:
2.3 Gaussian量化计算软件
Gaussian软件是目前使用较广泛的一款量子化学计算软件,其最新版本是Gaussian16。Gaussian软件通常包括用于计算的Gaussian和用于图形界面处理的GaussView两个组件。其中Gaussian软件涵盖了从头算方法、密度泛函方法和半经验方法等多种计算方法[13]。密度泛函理论基于Hohenberg-Kohn定理,将3N维多电子波函数问题简化为3维电子密度问题,用电子密度分布函数求解薛定谔方程,从而得到系统总能量及相关性质。Gaussian中,可通过对优化好的结构进行频率分析,进而计算分子的内能、焓、吉布斯自由能等热力学量。Gaussian中吉布斯自由能的计算过程为G = Eele + Gcorr,其中Eele为单点能,即分子的电子能量,包括电子的动能、电子与原子核间的势能、电子之间的相互作用能以及原子核之间的相互作用能;Gcorr则是温度与压力的影响所带来的吉布斯自由能修正项。由于实验上许多构成电池的分子与离子的溶剂化自由能较难直接测得,故本实验采用Gaussian计算方法得到离子的溶剂化自由能,进而计算出Cu-Zn原电池的标准电动势。
实验中Cu2+的溶剂化自由能
图2
3 实验设备
Gaussian 16软件,GaussView 5.0软件,DELL台式电脑(处理器:i5-6500;核心数:4;运行内存:32GB)。
4 实验步骤
4.1 用M06-2X/6-31G(d)密度泛函方法和SMD模型进行单点能的计算
构建初始结构,打开GaussView,点击Cu原子,保存为输入文件(*.gjf),采用M06-2X/6-31G(d)密度泛函方法,对Cu2+进行单点能的计算。M06-2X属于Truhlar课题组开发的明尼苏达泛函系列,是采用广义近似梯度的杂化密度泛函之一[14]。6-31G(d)是基组的名称,表示内层轨道用6个Gauss型函数(GTO)拟合1个Slater型函数(STO),这1个STO拟合1个原子轨道,价层轨道分为内(I)、外(O)轨道,内层轨道用3个GTO拟合1个STO(I),外层轨道用1个GTO拟合一个STO(O),然后1个STO(I)和STO(O)拟合一个价层原子轨道;在6-31G基组的基础上给重原子添加了d轨道极化函数。
编辑输入文件,Gaussian中默认的计算项目即单点能计算,因此计算单点能时关键词sp可不写。Gaussian默认状态为气相的计算,不需额外增加关键词,溶液相的计算则需要添加溶剂模型。溶剂模型包括隐式溶剂模型和显式溶剂模型,前者不考虑溶剂分子的实际结构,只把溶剂视为具有一定介电常数的连续介质,后者则是计算时在体系中直接增加溶剂分子,考虑溶质与溶剂分子间的相互作用以及溶剂分子的不同排布方式,这会导致计算量大幅增加。本实验采用的SMD溶剂模型[15],是由Truhlar及其合作者发展的一种参数化的基于SCRF的隐式溶剂化模型,该模型已经用2821个溶剂化数据的训练集进行了参数化,包括112个水性离子溶剂化自由能。Gaussian中使用scrf关键词来调用溶剂模型,因此在计算执行命令行关键词中需添加“scrf=SMD”,因SMD模型默认的溶剂为水,故“solvent=water”可不写。在电荷与多重度行,Cu2+的电荷为+2,有一个单电子,因此电荷和多重度设置为“2 2”。Cu2+的坐标直接设定为“0.0 0.0 0.0”,气相单点能计算输入文件如表 2所示。溶液相单点能计算的输入文件只需将表 2中执行命令行关键词中加上“scrf=SMD”。
表2 Cu2+气相单点能计算输入文件
| 内容 | 注释 |
| %nprocshared=12 | 使用12个核心并运行计算 |
| %chk=Cu2+_g-sp.chk | chk文件的存储位置 |
| # m062x 6-31g(d) | 计算执行路径,指定计算方法、基组、计算项目 |
| Cu2+_g-sp | 标题行 |
| 2 2 | 电荷与自旋多重度 |
| Cu 0.00000000 0.00000000 0.00000000 | 元素符号与笛卡尔坐标 |
输入文件编辑完成后,点击GaussView中“Calculation”下拉菜单“Gauss Calculation Setup”命令进入设置Gaussian计算选项,点击“Submit”选项,提交计算任务,也可通过在Gaussian软件中打开已建立的输入文件,进行计算任务提交。计算完成后会得到单点能计算的输出文件(*.log,若用Gaussian软件直接提交计算,则输出文件格式为*.out)。用文本编辑器打开输出文件,在“HF=”处读取Cu2+和Zn2+气相和溶液相的单点能数据。
4.2 Cu2+和Zn2+溶剂化自由能的计算
由4.1小节中提取的Cu2+和Zn2+气相和溶液相单点能数值,计算得到它们的溶剂化自由能
所以,
4.3 Cu-Zn原电池标准电动势的计算
将Gaussian计算得到的溶剂化自由能与查到的原子升华自由能[9]和电离自由能变[10]按式(3)进行计算,可以得到Cu电极发生还原反应时的标准吉布斯自由能
5 结果与讨论
表3
Cu2+和Zn2+溶剂化自由能的量化计算值
| 物种 | Eele(g)/hartree * | Eele(q)/hartree | |||
| Cu2+ | −1639.16842165 | −1639.91593249 | −20.2578 | −10.8446 | – |
| Zn2+ | −1778.07288886 | −1778.82510413 | −20.3858 | – | −7.9553 |
*1 hartree = 2625.5 kJ∙mol−1 = 627.51 kcal∙mol−1 = 27.21 eV
根据表 3中Gaussian计算的溶剂化自由能,可计算得到Cu-Zn原电池电极反应的
可见
根据文献[16],考虑到Cu2+添加一些显式的溶剂水分子,再对Cu2+的水合团簇使用SMD模型计算团簇的溶剂化自由能,利用热力学循环便能求出Cu2+的溶剂化自由能。此方法称为团簇连续化溶剂模型,是一种结合了显隐式溶剂模型的混合溶剂模型,考虑了溶质分子真实的溶剂化结构,使溶剂化自由能的计算结果更精确。因此,在使用量化软件进行计算时,不仅需要正确的理论方法,还需要选用合适的模型。
6 思考与拓展阅读
1) 根据计算结果得知本实验的误差主要来自于离子溶剂化自由能的计算过程,请思考原因。尝试更换计算方法,看能否解决这个问题。
2) 请阅读文献[16],尝试用团簇连续化溶剂模型计算Cu2+和Zn2+溶剂化自由能,并与实验值进行比较。
7 结语
本实验以计算机作为实验工具,发展了经典的“电动势的测定”这一物理化学实验。在实验中,学生可通过操作Gaussian 16软件线上开展Cu-Zn原电池标准电动势的测定实验,可与线下实际操作互补结合。学生通过自主设计热力学循环,计算出原电池反应的标准摩尔吉布斯自由能变,进而得到Cu-Zn原电池的标准电动势。此实验可实现现代化信息化技术与实验教学有效融合,帮助学生加深对标准摩尔吉布斯自由能、电极电势以及电池电动势等基本概念的理解,引导学生进行发散思维,感悟计算方法中严密的逻辑关系,有利于提高学生分析解决问题能力、科学研究能力与动手实践能力。
参考文献
DOI:10.1021/jp810292n [本文引用: 1]
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